W zależności od ilości danych do przetworzenia generowanie pliku może się wydłużyć.

Jeśli generowanie trwa zbyt długo można ograniczyć dane np. zmniejszając zakres lat.

Artykuł

Pobierz BibTeX

Tytuł

Transcriptome-derived investigation of biosynthesis of quinolizidine alkaloids in narrow-leafed lupin (Lupinus angustifolius L.) highlights candidate genes linked to iucundus locus

Autorzy

[ 1 ] Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk, Polska Akademia Nauk | [ P ] pracownik

Dyscyplina naukowa (Ustawa 2.0)

[7.5] Nauki biologiczne

Rok publikacji

2019

Opublikowano w

Scientific Reports

Rocznik: 2019 | Tom: 9

Typ artykułu

artykuł naukowy

Język publikacji

angielski

Słowa kluczowe
EN
Streszczenie

EN Unravelling the biosynthetic pathway of quinolizidine alkaloids (QAs), regarded as antinutritional compounds of narrow-leafed lupin (NLL) seeds, is fundamental to best exploit NLL as food or feed. We investigated 12 candidate genes connected to QA biosynthesis, selecting them by transcriptomic and genomic approaches, from the landscape of genes differentially expressed in leaves of the high- and low-alkaloid NLL accessions. Linkage analysis enabled the assessment of the location of the candidate genes in relation to iucundus, a major locus of unknown identity, that confers reduced QA content in seeds. The key finding was the identification of APETALA2/ethylene response transcription factor, RAP2-7, cosegregating with the iucundus locus and located within a region with highly significant QTLs that affect QA composition. We additionally identified a 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase (DHDPS) gene involved in L-lysine biosynthesis as being closely linked to iucundus. The distributed location of other remaining candidates (including previously known QA genes) across different linkage groups, also indirectly supports the transcription factor as a possible regulator of lupin alkaloid biosynthesis. Our findings provide crucial insight into QA biosynthesis in NLL. Additionally, we evaluated and selected appropriate reference genes for qRT-PCRs to analyse the expression levels of QA genes in NLL. © 2019, The Author(s).

Strony (od-do)

2231

DOI

10.1038/s41598-018-37701-5

URL

https://www.nature.com/articles/s41598-018-37701-5

Typ licencji

CC BY-ND (uznanie autorstwa - bez utworów zależnych)

Wersja tekstu w otwartym dostępie

ostateczna wersja opublikowana

Data udostępnienia

02.2019

Czas udostępnienia publikacji w sposób otwarty

w momencie opublikowania

Punktacja Ministerstwa / czasopismo

140

Punktacja Ministerstwa / czasopismo w ewaluacji 2017-2021

140