Tytuł
RNAvista: a webserver to assess RNA secondary structures with non-canonical base pairs
Autorzy
[ 1 ] Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk, Polska Akademia Nauk | [ P ] pracownik
Dyscyplina naukowa (Ustawa 2.0)
Rok publikacji
2019
Opublikowano w
Typ artykułu
artykuł naukowy
Język publikacji
angielski
Słowa kluczowe
Streszczenie
EN Motivation: In the study of 3D RNA structure, information about non-canonical interactions between nucleobases is increasingly important. Specialized databases support investigation of this issue based on experimental data, and several programs can annotate non-canonical base pairs in the RNA 3D structure. However, predicting the extended RNA secondary structure which describes both canonical and non-canonical interactions remains difficult. Results: Here, we present RNAvista that allows predicting an extended RNA secondary structure from sequence or from the list enumerating canonical base pairs only. RNAvista is implemented as a publicly available webserver with user-friendly interface. It runs on all major web browsers.
Strony (od-do)
152 - 155
Typ licencji
CC BY-NC (uznanie autorstwa - użycie niekomercyjne)
Wersja tekstu w otwartym dostępie
ostateczna wersja opublikowana
Data udostępnienia
07.2018
Czas udostępnienia publikacji w sposób otwarty
przed opublikowaniem
Punktacja Ministerstwa / czasopismo
200
Punktacja Ministerstwa / czasopismo w ewaluacji 2017-2021
200
Ten serwis działa dzięki oprogramowaniu SINUS
opracowanemu przez Poznańskie Centrum Superkomputerowo-Sieciowe
Zaloguj się, aby dodać do SIN: