Tytuł
Improved RE31 Analogues Containing Modified Nucleic Acid Monomers: Thermodynamic, Structural, and Biological Effects
Autorzy
[ 1 ] Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk, Polska Akademia Nauk | [ P ] pracownik
Dyscyplina naukowa (Ustawa 2.0)
Rok publikacji
2019
Opublikowano w
Typ artykułu
artykuł naukowy
Język publikacji
angielski
Słowa kluczowe
Streszczenie
EN RE31 is a 31-nt DNA aptamer, consisting of the G-quadruplex and a duplex domain, which is able to effectively prolong thrombin time. This article reports on the influence of certain modified nucleotide residues on thermodynamic and biological properties as well as the folding topology of RE31. Particularly, the effect of the presence of nucleosides in unlocked nucleic acid (UNA), locked nucleic acid (LNA), or beta-L-RNA series was evaluated. The studies presented herein show that all modified residues can influence thermal and biological stabilities of G-quadruplex in a position-dependent manner. The aptamers modified simultaneously with UNA at the T-15 position and LNAs in the duplex part possess the highest value of melting temperature and a 2-fold higher anticoagulant effect. Importantly, RE31 variants modified with nucleosides in UNA, LNA, or beta-L-RNA series exhibit unchanged G-quadruplex folding topology. Crucially, introduction of any of the modified residues into RE31 causes prolongation of aptamer stability in human serum.
Strony (od-do)
2499 - 2507
Punktacja Ministerstwa / czasopismo
200
Punktacja Ministerstwa / czasopismo w ewaluacji 2017-2021
200
Ten serwis działa dzięki oprogramowaniu SINUS
opracowanemu przez Poznańskie Centrum Superkomputerowo-Sieciowe
Zaloguj się, aby dodać do SIN: