Tytuł
A strong preference for the TA/TA dinucleotide step discovered for an acridine-based, potent antitumor dsDNA intercalator, C-1305: NMR-driven structural and sequence-specificity studies.
Autorzy
[ 1 ] Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk, Polska Akademia Nauk | [ P ] pracownik
Dyscyplina naukowa (Ustawa 2.0)
Rok publikacji
2020
Opublikowano w
Typ artykułu
artykuł naukowy
Język publikacji
angielski
Słowa kluczowe
Streszczenie
PL Triazoloacridinone C-1305, a potent antitumor agent recommended for Phase I clinical trials, exhibits high activity towards a wide range of experimental colon carcinomas, in many cases associated with complete tumor regression. C-1305 is a well-established dsDNA intercalator, yet no information on its mode of binding into DNA is available to date. Herein, we present the NMR-driven and MD-refined reconstruction of the 3D structures of the d(CGATATCG)(2):C-1305 and d(CCCTAGGG)(2):C-1305 non-covalent adducts. In both cases, the ligand intercalates at the TA/TA site, forming well-defined dsDNA:drug 1:1 mol/mol complexes. Orientation of the ligand within the binding site was unambiguously established by the DNA/ligand proton-proton NOE contacts. A subsequent, NMR-driven study of the sequence-specificity of C-1305 using a series of DNA duplexes, allowed us to confirm a strong preference towards TA/TA dinucleotide steps, followed by the TG/CA steps. Interestingly, no interaction at all was observed with duplexes containing exclusively the AT/AT, GG/CC and GA/TC steps.
Strony (od-do)
11697
Typ licencji
CC BY-ND (uznanie autorstwa - bez utworów zależnych)
Wersja tekstu w otwartym dostępie
ostateczna wersja opublikowana
Data udostępnienia
07.2020
Czas udostępnienia publikacji w sposób otwarty
w momencie opublikowania
Punktacja Ministerstwa / czasopismo
140
Punktacja Ministerstwa / czasopismo w ewaluacji 2017-2021
140
Ten serwis działa dzięki oprogramowaniu SINUS
opracowanemu przez Poznańskie Centrum Superkomputerowo-Sieciowe
Zaloguj się, aby dodać do SIN: