Tytuł
Different Research Approaches in Unraveling the Venom Proteome of Naja ashei
Autorzy
[ 1 ] Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk, Polska Akademia Nauk | [ P ] pracownik
Dyscyplina naukowa (Ustawa 2.0)
Rok publikacji
2020
Opublikowano w
Typ artykułu
artykuł naukowy
Język publikacji
angielski
Słowa kluczowe
Streszczenie
EN The dynamic development of venomics in recent years has resulted in a significant increase in publicly available proteomic data. The information contained therein is often used for comparisons between different datasets and to draw biological conclusions therefrom. In this article, we aimed to show the possible differences that can arise, in the final results of the proteomic experiment, while using different research workflows. We applied two software solutions (PeptideShaker and MaxQuant) to process data from shotgun LC-MS/MS analysis ofNaja asheivenom and collate it with the previous report concerning this species. We were able to provide new information regarding the protein composition of this venom but also present the qualitative and quantitative limitations of currently used proteomic methods. Moreover, we reported a rapid and straightforward technique for the separation of the fraction of proteins from the three-finger toxin family. Our results underline the necessary caution in the interpretation of data based on a comparative analysis of data derived from different studies.
Strony (od-do)
1282
Typ licencji
CC BY-ND (uznanie autorstwa - bez utworów zależnych)
Wersja tekstu w otwartym dostępie
ostateczna wersja opublikowana
Data udostępnienia
09.2020
Czas udostępnienia publikacji w sposób otwarty
w momencie opublikowania
Punktacja Ministerstwa / czasopismo
100
Punktacja Ministerstwa / czasopismo w ewaluacji 2017-2021
100
Ten serwis działa dzięki oprogramowaniu SINUS
opracowanemu przez Poznańskie Centrum Superkomputerowo-Sieciowe
Zaloguj się, aby dodać do SIN: