W zależności od ilości danych do przetworzenia generowanie pliku może się wydłużyć.

Jeśli generowanie trwa zbyt długo można ograniczyć dane np. zmniejszając zakres lat.

Artykuł

Pobierz BibTeX

Tytuł

Copy Number Variants Contributing to Combined Pituitary Hormone Deficiency

Autorzy

Rok publikacji

2020

Opublikowano w

International Journal of Molecular Sciences

Rocznik: 2020 | Tom: 21 | Numer: 16

Typ artykułu

artykuł naukowy

Język publikacji

angielski

Słowa kluczowe
EN
Streszczenie

EN Combined pituitary hormone deficiency represents a disorder with complex etiology. For many patients, causes of the disease remain unexplained, despite usage of advanced genetic testing. Although major and common transcription factors were identified two decades ago, we still struggle with identification of rare inborn factors contributing to pituitary function. In this report, we follow up genomic screening of CPHD patient cohort that were previously tested for changes in a coding sequences of genes with the use of the whole exome. We aimed to find contribution of rare copy number variations (CNVs). As a result, we identified genomic imbalances in 7 regions among 12 CPHD patients. Five out of seven regions showed copy gains whereas two presented losses of genomic fragment. Three regions with detected gains encompassed known CPHD genes namelyLHX4, HESX1, andOTX2. Among new CPHD loci, the most interesting seem to be the region coveringSIX3gene, that is abundantly expressed in developing brain, and together withHESX1contributes to pituitary organogenesis as it was evidenced before in functional studies. In conclusion, with the use of broadened genomic approach we identified copy number imbalances for 12 CPHD patients. Although further functional studies are required in order to estimate its true impact on expression pattern during pituitary organogenesis and CPHD etiology.

Strony (od-do)

5757

DOI

10.3390/ijms21165757

URL

https://www.mdpi.com/1422-0067/21/16/5757/pdf

Typ licencji

CC BY-ND (uznanie autorstwa - bez utworów zależnych)

Wersja tekstu w otwartym dostępie

ostateczna wersja opublikowana

Data udostępnienia

08.2020

Czas udostępnienia publikacji w sposób otwarty

w momencie opublikowania

Punktacja Ministerstwa / czasopismo

140

Punktacja Ministerstwa / czasopismo w ewaluacji 2017-2021

140