EN Nanopore Sequencing and its Application in Biology

2020

Postępy biochemii

Rocznik: 2020 | Tom: 66 | Numer: 3

artykuł naukowy

polski

PL Sekwencjonowanie nanoporowe nalezy do technik tzw. trzeciej generacji. Polega ono na elektroforetycznym transporcie kwasow nukleinowych przez kanaly bialkowe o nanometrowych rozmiarach (nanopory) i identyfikacji ich sekwencji na podstawie zmian mierzonego sygnalu elektrycznego. Technika nanoporowa pozwolila na znaczace wydluzenie odczytow sekwencyjnych oraz bezposrednie sekwencjonowanie natywnych czasteczek DNA i RNA. W efekcie, w ciagu zaledwie kilku lat od czasu wprowadzenia pierwszego sekwenatora nanoporowego, stala sie ona jedna z wiodacych technik sekwencjonowania. Zakres zastosowan techniki nanoporowej jest bardzo szeroki i obejmuje w szczegolnosci asemblacje genomow, badanie zmiennosci strukturalnej, identyfikacje modyfikacji kwasow nukleinowych oraz badanie alternatywnego skladania transkryptow. Dzieki swojej dostepnosci i prostocie, sekwencjonowanie nanoporowe jest rowniez coraz powszechniej stosowane w badaniach epidemiologicznych i rolnictwie, do szybkiej identyfikacji i monitorowania rozprzestrzeniania sie chorobotworczych bakterii oraz wirusow.

EN Nanopore sequencing is a third generation sequencing technique. It involves the electrophoretic transport of nucleic acids through the protein channels of nanometer size, called nanopores, followed by deciphering their nucleotide sequence, based on the changes in the measured electrical signal. The nanopore technique allowed for remarkable extending the sequencing read lengths and enabled direct sequencing of native DNA and RNA molecules. As a result, within just a few-year period since the release of the first nanopore sequencer, it has become one of the leading sequencing technologies. The broad scope of nanopore sequencing applications includes, in particular, genome assembly, structural variation studies, identification of nucleic acid chemical modifications and transcript alternative splicing studies. Portable, easy to operate, nanopore sequencers are also increasingly used in epidemiological and agricultural research to quickly identify and monitor the spread of pathogenic bacteria and viruses.

193 - 204

10.18388/pb.2020_328

https://postepybiochemii.ptbioch.edu.pl/index.php/PB/article/download/328/617

CC BY-ND (uznanie autorstwa - bez utworów zależnych)

ostateczna wersja opublikowana

08.2020

w momencie opublikowania

20

70