W zależności od ilości danych do przetworzenia generowanie pliku może się wydłużyć.

Jeśli generowanie trwa zbyt długo można ograniczyć dane np. zmniejszając zakres lat.

Artykuł

Pobierz BibTeX

Tytuł

How bioinformatics resources work with G4 RNAs

Autorzy

[ 1 ] Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk, Polska Akademia Nauk | [ P ] pracownik

Dyscyplina naukowa (Ustawa 2.0)

[2.3] Informatyka techniczna i telekomunikacja
[7.6] Nauki chemiczne

Rok publikacji

2021

Opublikowano w

Briefings in Bioinformatics

Rocznik: 2021 | Tom: 22 | Numer: 3

Typ artykułu

artykuł naukowy

Język publikacji

angielski

Słowa kluczowe
EN
Streszczenie

EN Quadruplexes (G4s) are of interest, which increases with the number of identified G4 structures and knowledge about their biomedical potential. These unique motifs form in many organisms, including humans, where their appearance correlates with various diseases. Scientists store and analyze quadruplexes using recently developed bioinformatic tools—many of them focused on DNA structures. With an expanding collection of G4 RNAs, we check how existing tools deal with them. We review all available bioinformatics resources dedicated to quadruplexes and examine their usefulness in G4 RNA analysis. We distinguish the following subsets of resources: databases, tools to predict putative quadruplex sequences, tools to predict secondary structure with quadruplexes and tools to analyze and visualize quadruplex structures. We share the results obtained from processing specially created RNA datasets with these tools.

Strony (od-do)

bbaa201-1 - bbaa201-14

DOI

10.1093/bib/bbaa201

URL

https://academic.oup.com/bib/advance-article/doi/10.1093/bib/bbaa201/5902714

Punktacja Ministerstwa / czasopismo

140

Punktacja Ministerstwa / czasopismo w ewaluacji 2017-2021

140