W zależności od ilości danych do przetworzenia generowanie pliku może się wydłużyć.

Jeśli generowanie trwa zbyt długo można ograniczyć dane np. zmniejszając zakres lat.

Artykuł

Pobierz BibTeX

Tytuł

The m6A RNA Modification Quantity and mRNA Expression Level of RNA Methylation-Related Genes in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma Cell Lines and Patients

Autorzy

[ 1 ] Instytut Chemii Bioorganicznej Polskiej Akademii Nauk, Polska Akademia Nauk | [ P ] pracownik

Dyscyplina naukowa (Ustawa 2.0)

[7.5] Nauki biologiczne

Rok publikacji

2021

Opublikowano w

Biomolecules

Rocznik: 2021 | Tom: 11 | Numer: 6

Typ artykułu

artykuł naukowy

Język publikacji

angielski

Słowa kluczowe
EN
Streszczenie

EN RNA methylation at the nitrogen sixth of adenosine (m(6)A, N-6-methyladenosine) is the most abundant RNA modification which plays a crucial role in all RNA metabolic aspects. Recently, m(6)A modification has been assigned to mediate the biological processes of cancer cells, but their significance in HNSCC development is still poorly described. Thus, the main aim of this study was to globally quantify m(6)A modification by the mass spectrometry approach and determine the mRNA expression level of selected m(6)A RNA methyltransferase (METTL3), demethylase (FTO), and m(6)A readers (YTHDF2, YTHDC2) in 45 HNSCC patients and 4 cell lines (FaDu, Detroit 562, A-253 and SCC-15) using qPCR. In the results, we have not observed differences in the global amount of m(6)A modification and the mRNA level of the selected genes between the cancerous and paired-matched histopathologically unchanged tissues from 45 HNSCC patients. However, we have found a positive correlation between selected RNA methylation machinery genes expression and m(6)A abundance on total RNA and characterized the transcript level of those genes in the HNSCC cell lines. Moreover, the lack of global m(6)A differences between cancerous and histopathologically unchanged tissues suggests that m(6)A alterations in specific RNA sites may specifically influence HNSCC tumorigenesis.

Strony (od-do)

908

DOI

10.3390/biom11060908

URL

https://www.mdpi.com/2218-273X/11/6/908/pdf

Typ licencji

CC BY-ND (uznanie autorstwa - bez utworów zależnych)

Wersja tekstu w otwartym dostępie

ostateczna wersja opublikowana

Data udostępnienia

06.2021

Czas udostępnienia publikacji w sposób otwarty

w momencie opublikowania

Punktacja Ministerstwa / czasopismo

100

Punktacja Ministerstwa / czasopismo w ewaluacji 2017-2021

100