1.

16th International Conference on Telecommunications (ConTEL) / Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE), 2021

Redakcja monografii naukowej

2.

A computationally designed β-amino acid-containing miniprotein / Magda Drewniak-Świtalska, Łukasz Berlicki, Wojciech Rypniewski (IChB), Paulina Fortuna, Magdalena Bejger (IChB), Jacek Plewka // Chemical Communications - 2021, 57, nr 49, s. 6015-6018

Artykuł naukowy 200

3.

Crystal structure of Z-DNA in complex with the polyamine putrescine and potassium cations at ultra-high resolution / Mariusz Jaskólski (IChB), Mirosław Gilski (IChB), Paweł Drożdżal (IChB) // Acta Crystallographica Section B-Structural Science Crystal Engineering and Materials - 2021, 77, 3, s. 331-338

Artykuł naukowy 140

4.

Crystal structures of the elusive Rhizobium etli l-asparaginase reveal a peculiar active site / Mariusz Jaskólski (IChB), Joanna I. Loch, Barbara Imiołczyk (IChB), Magdalena Bejger (IChB), Mirosław Gilski (IChB), Anna Wantuch, Joanna Śliwiak (IChB) // Nature Communications - 2021, 12, 1

Artykuł naukowy 200

5.

Epitranscriptomics of Ischemic Heart Disease—The IHD-EPITRAN Study Design and Objectives / Fausto Biancari, Jan Kiss, Daria Blokhina, Christoffer Stark, Vilbert Sikorski, Esko Kankuri, Mati Karelson, Pertti Koivisto, Mikko Jormalainen, Pia Bäckström, Helena Rajala, Outi Elomaa, Mika Laine, Antti Nykänen, Shintaro Katayama, Antti Vento, Kati Oksaharju, Peter Raivio, Eero Mervaala, Jussi Ropponen, Tommi Vähäsilta, Jahangir Khan, Tatu Juvonen, Pasi Karjalainen, Simo Syrjälä, Jari Laurikka, Satu Suihko, Jarmo Simpanen, Karl Lemström, Markku Kaarne, Annu Nummi, Tiina Vainikka, Kimmo Savinainen, Suvi Tuohinen, Arda Eskin, Maciej Łałowski (IChB), Nurcan Tuncbag, Kari Teittinen, Sebastian Dahlbacka // International Journal of Molecular Sciences - 2021, 22, 12, s. 6630

Artykuł naukowy 140

6.

Impact of a Single Nucleotide Change or Non-Nucleoside Modifications in G-Rich Region on the Quadruplex–Duplex Hybrid Formation / Piotr Kozłowski (IChB), Daniel Baranowski (IChB), Zofia Gdaniec (IChB), Dorota Gudanis (IChB), Ryszard Kierzek (IChB), Karolina Zielińska (IChB) // Biomolecules - 2021, 11, 8, s. 1236

Artykuł naukowy 100

7.

Implications of Oxidative Stress in Glioblastoma Multiforme Following Treatment with Purine Derivatives / Patrycja Krawczyk, Paweł Pawelczak, Dorota Gurda-Woźna (IChB), Tomasz Ostrowski (IChB), Agnieszka Fedoruk-Wyszomirska (IChB), Grzegorz Framski (IChB), Eliza Wyszko (IChB), Marta Orlicka-Płocka (IChB), Małgorzata Giel-Pietraszuk (IChB) // Antioxidants - 2021, 10, 6, s. 950

Artykuł naukowy 100

8.

Leveraging Agri-food IoT Solutions to Connect Apiary Owners and Farmers / Michał Błaszczak, Szymon Mueller (PCSS), Raul Palma (PCSS), Marcin Płóciennik (PCSS), Brahma Soumya, Szymon Kupiński (PCSS), Adam Świątkowski, Arkadiusz Radziuk // W: 16th International Conference on Telecommunications (ConTEL): Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE), 2021 - s. 152-158

Rozdział w monografii naukowej 20

9.

Serendipitous synthesis of unsymmetrical porphyrazine: Incomplete transesterification during macrocyclization / Anna Teubert (IChB), Monika Kasprzycka, Weronika Porolnik, Jaroslaw Piskorz // INORGANIC CHEMISTRY COMMUNICATIONS - 2021, 133, s. 108953

Artykuł naukowy 40

10.

The oncogene AAMDC links PI3K-AKT-mTOR signaling with metabolic reprograming in estrogen receptor-positive breast cancer / Rabab Rashwan, Agustin Sgro, Charlene Waryah, Bartosz Wasag, Iwona Kardaś, Magdalena Ratajska, Kim A. Lagerborg, Emily Golden, Joseph Cursons, Heng B. See, Christina Curtis, Anabel Sorolla, Elisabet Cuyàs, Piotr Czapiewski, Andrew Redfern, Wojciech Biernat, Andrew J. Woo, Elizabeth K. M. Johnstone, Mohit Jain, Ciara Duffy, Kevin D. G. Pfleger, Pilar Blancafort, Wan Jun Tie, Jeremy Parry, Javier A. Menendez, Bum-Kyu Lee, Piotr Kozłowski (IChB), Edina Wang, Adam Gorczyński, Eleanor A. Woodward, Jonghwan Kim, Nathan J. Pavlos // Nature Communications - 2021, 12, 1

Artykuł naukowy 200

11.

Triazole-Modified Nucleic Acids for the Application in Bioorganic and Medicinal Chemistry / Dagmara Baraniak (IChB), Jerzy Boryski (IChB) // Biomedicines - 2021, 9, 6, s. 628

Artykuł naukowy 100

12.

Tutorial applications for Verification, Validation and Uncertainty Quantification using VECMA toolkit / Dongwei Ye, Daan Crommelin, Pavel Zun, Jalal Lakhlili, Lourens Veen, Hamid Arabnejad, Peter V. Coveney, Diana Suleimenova, Onnie O. Luk, Wouter N. Edeling, Derek Groen, Alfons Hoekstra, Vytautas Jancauskas, David Coster, Valeria Krzhizhanovskaya, Michał Kulczewski (PCSS) // Journal of Computational Science - 2021, 53, s. numer artykułu: 101402

Artykuł naukowy 100

13.

Verification, Validation and Uncertainty Quantification of Large-Scale Applications with QCG-PilotJob / Bartosz Bosak (PCSS), Erwan Raffin, Jalal Lakhlili, Tomasz Piontek (PCSS), Paul Karlshoefer, Piotr Kopta (PCSS) // W: Computational Science – ICCS 2021 : 21st International Conference, Krakow, Poland, June 16–18, 2021, Proceedings, 2021 - s. 495 - 501

Rozdział w monografii naukowej / referat 140

14.

A Cloud-Based Framework for Machine Learning Workloads and Applications / Alvaro Lopez Garcia, Mario David, Andy S. Alic, Germen Molto, Keiichi Ito, Lara Lloret Iglesias, Viet Tran, Marcin Płóciennik (PCSS), Miguel Caballer, Marica Antonacci, Isabel Campos Plasencia, Valentin Y. Kozlov, Ignacio Heredia Cacha, Paweł Wolniewicz (PCSS), Giacinto Donvito, Marcus Hardt, Alessandro Costantini, Giang Nguyen, Jorge Gomes, Zdenek Sustr, Jesus Marco De Lucas, Pablo Orviz Fernandez, Doina Cristina Duma, Wolfgang Zu Castell, Stefan Dlugolinsky // IEEE Access - 2020, 8, s. 18681-18692

Artykuł naukowy 100

15.

A Concept of Innovation Hub for Smart Applications, Enabling Pro-active Approach to Urban Policy and Planning Processes / Cezary Mazurek (PCSS), Maciej Stroiński (PCSS) // W: Proceedings of the 53rd Hawaii International Conference on System Sciences, 2020 - s. 6589-6598

Rozdział w monografii naukowej / referat 140

16.

Anti-Influenza Strategies Based on Nanoparticle Applications / Barbara Szutkowska (IChB), Klaudia Wieczorek, Elżbieta Kierzek (IChB) // Pathogens - 2020, 9, 12, s. 1020

Artykuł naukowy 100

17.

A practical synthesis of nucleoside 5′-diphosphates from nucleoside 5′-H-phosphonate monoesters / Justyna Gołębiewska (IChB), Małgorzata Rożniewska, Marta Rachwalak, Tomasz Jakubowski, Michał Sobkowski (IChB), Joanna Romanowska (IChB) // Synthetic Communications - 2020, 50, 24, s. 3836-3844

Artykuł naukowy 40

18.

A Tale of Two Families: Whole Genome and Segmental Duplications Underlie Glutamine Synthetase and Phosphoenolpyruvate Carboxylase Diversity in Narrow-Leafed Lupin (Lupinus angustifolius L.) / Michał Książkiewicz, Barbara Naganowska, Anna Szczepaniak, Grzegorz Koczyk, Katarzyna Czyż, Jan Podkowiński (IChB) // International Journal of Molecular Sciences - 2020, 21, 7, s. 2580

Artykuł naukowy 140

19.

Building Confidence in Simulation: Applications of EasyVVUQ / Jalal Lakhlili, Bartosz Bosak (PCSS), Derek Groen, Tomasz Piontek (PCSS), Jan Węglarz, Irina Chirca, Peter V. Coveney, Onnie O. Luk, Olivier Hoenen, Hamid Arabnejad, Vytautas Jancauskas, Daan Crommelin, Diana Suleimenova, Robin A. Richardson, David W. Wright, Michał Kulczewski (PCSS), Wouter Edeling, Robert C. Sinclair, Piotr Kopta (PCSS) // Advanced Theory and Simulations - 2020, 3, 8, s. 1900246 (1-22)

Artykuł naukowy 20

20.

Disulfide bridge as a linker in nucleic acids’ bioconjugation. Part II: A summary of practical applications / Marcin Chmielewski (IChB), Anna R. Stasińska, Piotr Putaj // Bioorganic Chemistry - 2020, 95, s. 103518

Artykuł naukowy 100

21.

Energy efficiency and performance modeling of stencil applications on manycore and GPU computing resources / Jan Węglarz (PCSS), Krzysztof Kurowski (PCSS), Miłosz Ciżnicki (PCSS) // W: 2020 20th IEEE/ACM International Symposium on Cluster, Cloud and Internet Computing (CCGRID), 2020 - s. 232-241

Rozdział w monografii naukowej / referat 140

22.

INTELLIGENT SYSTEMS AND APPLICATIONS, VOL 2 / Springer, 2020

Redakcja monografii naukowej

23.

On Applying Ambient Intelligence to Assist People with Profound Intellectual and Multiple Disabilities / B. Rosario Campomanes-Alvarez, Piotr Szymaniak, Wojciech Kapsa, Gasper Slapnicar, Maciej Stroinski, Erik Dovgan, Carmen Campomanes-Alvarez, Michał Kosiedowski (PCSS), Matej Cigale, Arkadiusz Radziuk, Mitja Lustrek, Tomasz Rajtar // W: INTELLIGENT SYSTEMS AND APPLICATIONS, VOL 2: Springer, 2020 - s. 895-914

Rozdział w monografii naukowej 20

24.

On the Way to Understanding the Interplay between the RNA Structure and Functions in Cells: A Genome-Wide Perspective / Katarzyna Pachulska-Wieczorek (IChB), Małgorzata Zawadzka, Angelika Andrzejewska // International Journal of Molecular Sciences - 2020, 21, 18, s. 6770

Artykuł naukowy 140

25.

Organization of the Influenza A Virus Genomic RNA in the Viral Replication Cycle—Structure, Interactions, and Implications for the Emergence of New Strains / Aleksandra Jarmołowicz (IChB), Julita Piasecka (IChB), Elżbieta Kierzek (IChB) // Pathogens - 2020, 9, 11, s. 951

Artykuł naukowy 100

26.

Quantifying the mineralization of 13C-labeled cations and anions reveals differences in microbial biodegradation of herbicidal ionic liquids between water and soil / Anko Fischer, Agnieszka Zgoła-Grześkowiak, Mikołaj Owsianiak, Marta Woźniak-Karczewska, Łukasz Chrzanowski, Juliusz Pernak, Grzegorz Framski (IChB), Piotr Lisiecki, Michał Niemczak, Carsten Vogt, Wiktoria Wilms, Łukasz Ławniczak, Robin D. Rogers // ACS Sustainable Chemistry & Engineering - 2020, 8, 8, s. 3412-3426

Artykuł naukowy 140

27.

RNA Secondary Structure Motifs of the Influenza A Virus as Targets for siRNA-Mediated RNA Interference / Barbara Szutkowska (IChB), Marta Soszyńska-Jóźwiak (IChB), Julita Piasecka (IChB), Elżbieta Lenartowicz (IChB), Elżbieta Kierzek (IChB), Ryszard Kierzek (IChB) // Molecular Therapy-Nucleic Acids - 2020, 19, s. 627-642

Artykuł naukowy 140

28.

SEKWENCJONOWANIE NANOPOROWE I JEGO ZASTOSOWANIE W BIOLOGII / Agnieszka Żmieńko (IChB), Anastasiia Satyr // Postępy biochemii - 2020, 66, 3, s. 193-204

Artykuł naukowy 20

29.

Surface Modification of Luminescent Ln III Fluoride Core–Shell Nanoparticles with Acetylsalicylic acid (Aspirin): Synthesis, Spectroscopic and in Vitro Hemocompatibility Studies / Dorota Kwiatek (IChB), Stefan Lis, Lucyna Mrówczyńska, Andrzej Lesicki, Natalia Stopikowska, Marcin Runowski // ChemMedChem - 2020, 15, 15, s. 1490-1496

Artykuł naukowy 100

30.

Transformation of herbicides into dual function quaternary tropinium salts / Wiktoria Wilms, Marta Woźniak-Karczewska, Anna Syguda, Anna Parus, Grzegorz Framski (IChB), Łukasz Chrzanowski, Łukasz Ławniczak, Viktoriia Verkhovetska, Andrzej Borkowski, Beata Strzemiecka // New Journal of Chemistry - 2020, 44, 21, s. 8869-8877

Artykuł naukowy 70

31.

An Overview of Circular RNAs and Their Implications in Myotonic Dystrophy / Piotr Kozłowski (IChB), Marzena Wojciechowska (IChB), Karol Czubak (IChB), Saam Sedehizadeh // International Journal of Molecular Sciences - 2019, 20, 18, s. 4385

Artykuł naukowy 140

32.

Comparative benchmarking of HPC systems for GSS applications: GSS applications in the HPC ecosystem / Damian Kaliszan, Michael Gienger, Sebastian Petruczynik, Sergiy Gogolenko, Steffen Fürst, Norbert Meyer (PCSS) // W: Proceedings of International Conference on High Performance Computing in Asia-Pacific Region (HPCAsia2019), 2019 - s. 43-52

Rozdział w monografii naukowej / referat 70

33.

G-Quadruplex-Forming Aptamers—Characteristics, Applications, and Perspectives / Anna Pasternak (IChB), Carolina Roxo, Weronika Kotkowiak (IChB) // Molecules - 2019, 24, 20, s. 3781

Artykuł naukowy 100

34.

Spider Chitin. The biomimetic potential and applications of Caribena versicolor tubular chitin / Heike Meissner, David Rafaja, Martin Bertau, Marek Figlerowicz (IChB), Katarzyna Czaczyk, Stefan R. Bornstein, Alona Voronkina, Sonia Żółtowska-Aksamitowska, Mikhail Tsurkan, Marcin Wysokowski, Kaomei Guan, Yvonne Joseph, Tomasz Machałowski, Nicole Bechmann, Björn Binnewerg, Roberta Galli, Christian Schimpf, Teofil Jesionowski, Hermann Ehrlich, Oleg Pokrovsky, Mario Schubert, Andriy Fursov, Iaroslav Petrenko, Michael Kraft // Carbohydrate Polymers - 2019, 226, s. 115301

Artykuł naukowy 140

35.

Structural Stability of the Anticodon Stem Loop Domains of the Unmodified Yeast and Escherichia coli tRNAPhe: Differing Views from Different Force Fields / Indrajit Deb, Lennart Nilsson, Ansuman Lahiri, Joanna Sarzyńska (IChB) // ACS Omega - 2019, 4, 2, s. 3029-3044

Artykuł naukowy 70

36.

tRNA-derived fragments from the Sus scrofa tissues provide evidence of their conserved role in mammalian development / Marek Kazimierczyk, Jan Wrzesiński (IChB), Dorota Kowalczykiewicz, Barbara Imiołczyk (IChB), Jerzy Ciesiołka (IChB), Agata Jędroszkowiak, Maciej Szymański // Biochemical and Biophysical Research Communications - 2019, 520, 3, s. 514-519

Artykuł naukowy 100

37.

A Survey on Online Judge Systems and Their Applications / Jan Badura, Maciej Antczak (IChB), Szymon Wąsik, Tomasz Sternal, Artur Laskowski // ACM Computing Surveys - 2018, 51, 1, s. 3

Artykuł naukowy 50

38.

Automatic mapping of gaze position coordinates of eye-tracking glasses video on a common static reference image / Adam Bykowski, Szymon Kupiński (PCSS) // W: ETRA '18: Proceedings of the 2018 ACM Symposium on Eye Tracking Research & Applications, 2018

Rozdział w monografii naukowej / referat

39.

ETRA '18: Proceedings of the 2018 ACM Symposium on Eye Tracking Research & Applications / 2018

Monografia naukowa / materiały konferencyjne

40.

Evolutionary plasticity of the NHL domain underlies distinct solutions to RNA recognition / Heinz Gut, Helge Großhans, Katarzyna Pachulska-Wieczorek (IChB), Janusz Bujnicki, Pritha Ghosh, Jeremy Keusch, Anca Neagu, Rafał Ciosk (IChB), Pooja Kumari, Florian Aeschimann, Dimos Gaidatzis // Nature Communications - 2018, 9, s. 1549

Artykuł naukowy 45

41.

Legume Cytosolic and Plastid Acetyl-Coenzyme—A Carboxylase Genes Differ by Evolutionary Patterns and Selection Pressure Schemes Acting before and after Whole-Genome Duplications / Michał Książkiewicz, Barbara Naganowska, Marek Figlerowicz (IChB), Anna Szczepaniak, Katarzyna Czyż, Jan Podkowiński (IChB) // Genes - 2018, 9, 2, s. 563

Artykuł naukowy 25

42.

Metal-cation regulation of enzyme dynamics is a key factor influencing the activity of S-adenosyl-l-homocysteine hydrolase from Pseudomonas aeruginosa / Mariusz Jaskólski (IChB), Barbara Imiołczyk (IChB), Justyna Czyrko-Horczak, Krzysztof Brzeziński (IChB), Zofia Gdaniec (IChB), Joanna Śliwiak (IChB) // Scientific Reports - 2018, 8, s. 11334

Artykuł naukowy 40

43.

PSNC advanced multimedia and visualization infrastructures, services and applications / Mauricio Alvarez Mesa, Artur Binczewski (PCSS), Maciej Stróżyk (PCSS), Bogdan Ludwiczak (PCSS), Krzysztof Kurowski (PCSS), Miłosz Ciżnicki (PCSS), Maciej Głowiak (PCSS) // W: Proceedings of the 23rd International ACM Conference on 3D Web Technology: Association for Computing Machinery (ACM), 2018

Rozdział w monografii naukowej 20

44.

Identification of functional tetramolecular RNA G-quadruplexes derived from transfer RNAs / Pavel Ivanov, Zofia Gdaniec (IChB), Dorota Gudanis (IChB), Stephen M. Coyne, Shawn M. Lyons // Nature Communications - 2017, 8, s. Article Number: 1127

Artykuł naukowy 45

45.

Parallel-stranded DNA and RNA duplexes - structural features and potential applications / Marta Szabat (IChB), Ryszard Kierzek (IChB) // FEBS Journal - 2017, 284, 23, s. 3986-3998

Artykuł naukowy 30

46.

Proof of ion-pair structures in ammonium-based protic ionic liquids using combined NMR and DFT/PCM-based chemical shift calculations / Barbara Górska, Juliusz Pernak, Francois Beguin, Zofia Gdaniec (IChB), Marek Łożyński // Physical Chemistry Chemical Physics - 2017, 19, 36, s. 25033-25043

Artykuł naukowy 40