1.

A Helminth-Derived Chitinase Structurally Similar to Mammalian Chitinase Displays Immunomodulatory Properties in Inflammatory Lung Disease / Katja Lindner, Jürgen Zentek, Friederike Ebner, Arnd Heuser, Piotr Małecki (IChB), Manfred S. Weiss, Susanne Hartmann, Katharina Janek, Tara E. Sutherland, Anja A. Kühl, Andreas Hofmann, Agathe Niewienda // Journal of Immunology Research - 2021, 2021, s. 6234836

Artykuł naukowy 100

2.

A pan-cancer atlas of somatic mutations in miRNA biogenesis genes / Piotr Kozłowski (IChB), Paulina Gałka-Marciniak (IChB), Martyna Urbanek-Trzeciak (IChB), Paulina maria Nawrocka // Nucleic Acids Research - 2021, 49, 2, s. 601-620

Artykuł naukowy 200

3.

Broken symmetry between RNA enantiomers in a crystal lattice / Wojciech Rypniewski (IChB), Magdalena Bejger (IChB), Agnieszka Kiliszek (IChB), Leszek Błaszczyk (IChB) // Nucleic Acids Research - 2021, 49, 21, s. 12535–12539

Artykuł naukowy 200

4.

Caenorhabditis elegans as a model organism in obesity research / Agnieszka Chabowska-Kita (IChB), Aneta Dyczkowska // Biotechnologia - 2021, 102, 3, s. 337-362

Artykuł naukowy 70

5.

Entanglements of structure elements revealed in RNA 3D models / Maciej Antczak (IChB), Agnieszka Korpeta, Mariusz Popenda (IChB), Ryszard Adamiak (IChB), Marta Szachniuk (IChB), Tomasz Żok, Joanna Sarzyńska (IChB) // Nucleic Acids Research - 2021, 49, 17, s. 9625 - 9632

Artykuł naukowy 200

6.

Impact of cell harvesting methods on detection of cell surface proteins and apoptotic markers / Agnieszka Nowak-Terpiłowska, Joanna Zeyland, Paweł Śledziński (IChB) // Brazilian Journal of Medical and Biological Research - 2021, 54, 2

Artykuł naukowy 70

7.

In vivo structure of the Ty1 retrotransposon RNA genome / Angelika Andrzejewska, Katarzyna Pachulska-Wieczorek (IChB), David J Garfinkel, Małgorzata Zawadzka, Julita Gumna (IChB) // Nucleic Acids Research - 2021, 49, 5, s. 2878–2893

Artykuł naukowy 200

8.

Morphological changes in bitches endometrium affected by cystic endometrial hyperplasia - pyometra complex – the value of histopathological examination / Jędrzej M. Jaśkowski, Magdalena Kulus, Beata Błaszak, Magdalena Woźna-Wysocka (IChB), Bartłomiej M. Jaśkowski, Marta Rybska // BMC Veterinary Research - 2021, 17, 1

Artykuł naukowy 140

9.

Promoting Ethically Responsible Use of Agricultural Biotechnology / Jeremy Sweet, Vasiliki Petousi, Arie Altman, Tomasz Twardowski (IChB), Antoine L. Harfouche, Richard Meilan // Trends in Plant Science - 2021, 26, 6, s. 546-559

Artykuł naukowy 200

10.

Proteomic Profiling of Leukocytes Reveals Dysregulation of Adhesion and Integrin Proteins in Chronic Kidney Disease-Related Atherosclerosis / Joanna Tracz, Maria Wanic-Kossowska, Luiza Handschuh (IChB), Dorota Formanowicz, Łukasz Marczak (IChB), Bartłomiej Perek, Magdalena Łuczak (IChB), Katarzyna Kostka-Jeziorny, Andrzej Tykarski, Maciej Łałowski (IChB), Alina Podkowińska // Journal of Proteome Research - 2021, 20, 6, s. 3053-3067

Artykuł naukowy 100

11.

Base pairing, structural and functional insights into N4-methylcytidine (m4C) and N4,N4-dimethylcytidine (m42C) modified RNA / Phensinee Haruehanroengra, Fusheng Shen, Song Mao, Jia Sheng, Srivathsan V Ranganathan, Miłosz Ruszkowski (IChB), Bartosz Sekula, Ying Wu // Nucleic Acids Research - 2020, 48, 18, s. 10087-10100

Artykuł naukowy 200

12.

BRIP1, RAD51C, and RAD51D mutations are associated with high susceptibility to ovarian cancer: mutation prevalence and precise risk estimates based on a pooled analysis of ~30,000 cases / Piotr Kozłowski (IChB), Malwina Suszyńska (IChB), Magdalena Ratajska // Journal of Ovarian Research - 2020, 13, 1, s. 50

Artykuł naukowy 70

13.

Different Research Approaches in Unraveling the Venom Proteome of Naja ashei / Jaroslav Legáth, Aleksandra Bocian, Łukasz Marczak (IChB), Konrad Kamil Hus, Monika Petrillová, Vladimír Petrilla // Biomolecules - 2020, 10, 9, s. 1282

Artykuł naukowy 100

14.

Digital Library Adaptation for Traditional Music and Content-Based Research: Polish Sound Archives and dLibra / Jacek Jackowski, Tomasz Parkoła (PCSS), Ewa Dahlig-Turek, Ewa Kuśmierek (PCSS), Ewa Łukasik, Magdalena Chudy // W: JCDL '20: Proceedings of the ACM/IEEE Joint Conference on Digital Libraries in 2020: Association for Computing Machinery (ACM), 2020 - s. 289–298

Rozdział w monografii naukowej / referat 20 200

15.

Generation of human iPS cell line IBCHi002-A from spinocerebellar ataxia type 3/Machado-Joseph disease patient's fibroblasts. / Włodzimierz Krzyżosiak, Emilia Kozłowska (IChB), Agata Ciolak, Agnieszka Fiszer (IChB) // Stem Cell Research - 2020, 45, s. 101796

Artykuł naukowy 70

16.

Metagenomic analysis of β-lactamase and carbapenemase genes in the wastewater resistome / Katarzyna Nowis (IChB), Nicoletta Makowska-Zawierucha (IChB), Joanna Mokracka, Ryszard Koczura, Artur Trzebny, Anna Philips (IChB), Mirosława Dabert // Water Research - 2020, 170, s. 115277

Artykuł naukowy 140

17.

Molecular structure of a U•A-U-rich RNA triple helix with 11 consecutive base triples / Zbigniew Dauter, Agnieszka Ruszkowska (IChB), Miłosz Ruszkowski (IChB), Jacob P Hulewicz, Jessica A Brown // Nucleic Acids Research - 2020, 48, 6, s. 3304-3314

Artykuł naukowy 200

18.

RNA-Puzzles toolkit: a computational resource of RNA 3D structure benchmark datasets, structure manipulation, and evaluation tools / Marcin Magnus, Eric Westhof, Maciej Antczak (IChB), Janusz Bujnicki, Yang Cao, Piotr Łukasiak (IChB), Marta Szachniuk (IChB), Zhichao Miao, Tomasz Zok, Jakub Wiedemann // Nucleic Acids Research - 2020, 48, 2, s. 576 - 588

Artykuł naukowy 200

19.

Scheduling of network tasks to minimize the consumed energy / Marek Mika, Jan Węglarz, Bartosz Belter (PCSS) // International Transactions in Operational Research - 2020, 28, 1, s. 168-200

Artykuł naukowy 100

20.

SEKWENCJONOWANIE NANOPOROWE I JEGO ZASTOSOWANIE W BIOLOGII / Agnieszka Żmieńko (IChB), Anastasiia Satyr // Postępy biochemii - 2020, 66, 3, s. 193-204

Artykuł naukowy 20

21.

The abundance of the long intergenic non-coding RNA 01087 differentiates between luminal and triple-negative breast cancers and predicts patient outcome / Barbara Uszczyńska-Ratajczak (IChB), Alfonso Baldi, Francesco Salvatore, Maria Chiara Maiuri, Margerie Kremer, Gautier Stoll, Cecilia C. Klein, Gerardo Botti, Valentina Del Monaco, Massimiliano D’aiuto, Fatima Domenica Elisa De Palma, Donatella Montanaro, Guido Kroemer, Jonathan G. Pol, Valeria D’argenio, Anna Vlasova, Roderic Guigó // Pharmacological Research - 2020, 161, s. 105249

Artykuł naukowy 100

22.

The ICTBioMed NCIP Hub: Cancer research in a science gateway consortium / Cezary Mazurek (PCSS), Amar Bhat, Rajendra Joshi, Ken Buetow, Anil Srivastava, Kevin Wojkovich, Hemant Darbari, Sandra Gesing, Amit Saxena // Future Generation Computer Systems-The International Journal of eScience - 2020, 105, s. 27-32

Artykuł naukowy 140

23.

Anti-CyHV-3 effect of fluorescent, tricyclic derivative of acyclovir 6-(4-MeOPh)-TACV in vitro / Tomasz Ostrowski (IChB), Joanna Szczygieł, Agnieszka Troszok, Ludmiła Kolek, Mikołaj Adamek, Ilgiz Irnazarow // Journal of Veterinary Research - 2019, 63, 4, s. 513-518

Artykuł naukowy 20

24.

Enabling FAIR research in Earth Science through research objects / Francesco De Leo, Elisa Trasatti, Melissa A. Genazzio, Sergio Albani, Raul Palma (PCSS), Timothy Aldridge, Daniel Crawl, Michele Lazzarini, Andres Garcia-Silva, Vito Romaniello, Mirko Albani, Cristiano Silvagni, Fulvio Marelli, Fran Boler, Simone Mantovani, Jose Manuel Gomez-Perez, Christine Laney, Helen M. Glaves, Stefano Salvi, Hazel J. Napier, Federica Foglini, Marcin Krystek (PCSS), Valentina Grande, Charles Meertens, Ilkay Altintas, Rosemarie Leone, Henry W. Loescher // Future Generation Computer Systems-The International Journal of eScience - 2019, 98, s. 550-564

Artykuł naukowy 140

25.

Engineering Software Systems: Research and Praxis / Springer, 2019

Redakcja monografii naukowej

26.

Generation of human iPS cell line IBCHi001-A from dentatorubral–pallidoluysian atrophy patient's fibroblasts / Agata Ciołak, Emilia Kozłowska (IChB), Marta Olejniczak (IChB), Agnieszka Fiszer (IChB) // Stem Cell Research - 2019, 39, s. 1-5

Artykuł naukowy 70

27.

How Good Is My Project? Experiences from Projecting Software Quality Using a Reference Set / Cezary Mazurek (PCSS), Bartosz Walter, Marcin Wolski (PCSS), Jakub Chojnacki // W: Engineering Software Systems: Research and Praxis: Springer, 2019 - s. 192-207

Rozdział w monografii naukowej 20

28.

Iodide prevents proteins from oxidative damage. From traditional biochemical methods to crystallographic tools / Marta Ignasiak-Kciuk, Mariusz Jaskólski (IChB), Marta Grzechowiak (IChB), B. Shashikadze, Bartosz Marciniak // Free Radical Biology and Medicine - 2019, 139, S 1, s. 167

Artykuł naukowy 140

29.

Ionizing radiation affects the composition of the proteome of extracellular vesicles released by head-and-neck cancer cells in vitro / Agata Abramowicz, Piotr Widłak, Monika Pietrowska, Anna Wojakowska (IChB), Mateusz Smolarz, Łukasz Marczak (IChB), Joanna Polańska, Michael D. Story, Małgorzata Łysek-Gładysińska // Journal of Radiation Research - 2019, 60, 3, s. 289-297

Artykuł naukowy 70

30.

Massive Cryptosporidium infections and chronic diarrhea in HIV-negative patients / Krystyna Frąckowiak, Szymon Nowak, Łukasz Kuszel, Łukasz Pielok, Jerzy Stefaniak, Matylda Kłudkowska, Paweł Zmora (IChB) // Parasitology Research - 2019, 118, 6, s. 1937-1942

Artykuł naukowy 70

31.

MIRELA - Music Information Research Environment with dLibrA / Magdalena Chudy, Jacek Jackowski, Ewa Łukasik, Ewa Dahlig-Turek, Tomasz Parkoła (PCSS), Ewa Kuśmierek (PCSS) // W: DLfM '19: 6th International Conference on Digital Libraries for Musicology: Association for Computing Machinery (ACM), 2019 - s. 65-69

Rozdział w monografii naukowej 20

32.

MIRELA - Music Information Research Environment with dLibrA / Ewa Łukasik, Ewa Dahlig-Turek, Jacek Jackowski, Tomasz Parkoła (PCSS), Ewa Kuśmierek (PCSS), Magdalena Chudy // W: DLfM '19: 6th International Conference on Digital Libraries for Musicology: Association for Computing Machinery (ACM), 2019 - s. 65-69

Rozdział w monografii naukowej / referat 20

33.

Structural insights into synthetic ligands targeting A–A pairs in disease-related CAG RNA repeats / Ronald Micura, Wojciech Rypniewski (IChB), Asako Murata, Christoph Falschlunger, Agnieszka Kiliszek (IChB), Sanjukta Mukherjee, Kazuhiko Nakatani, Chikara Dohno, Leszek Błaszczyk (IChB) // Nucleic Acids Research - 2019, 47, 20, s. 10906-10913

Artykuł naukowy 200

34.

tRNA-derived fragments from the Sus scrofa tissues provide evidence of their conserved role in mammalian development / Marek Kazimierczyk, Jan Wrzesiński (IChB), Dorota Kowalczykiewicz, Barbara Imiołczyk (IChB), Jerzy Ciesiołka (IChB), Agata Jędroszkowiak, Maciej Szymański // Biochemical and Biophysical Research Communications - 2019, 520, 3, s. 514-519

Artykuł naukowy 100

35.

A Research Object-Based Toolkit to Support the Earth Science Research Lifecycle / Jose Manuel Gomez-Perez, Andres Garcia-Silva, Raul Palma (PCSS), Marcin Krystek (PCSS) // W: Proceedings - IEEE 14th International Conference on eScience, 2018

Rozdział w monografii naukowej / referat 140

36.

Automatic mapping of gaze position coordinates of eye-tracking glasses video on a common static reference image / Adam Bykowski, Szymon Kupiński (PCSS) // W: ETRA '18: Proceedings of the 2018 ACM Symposium on Eye Tracking Research & Applications, 2018

Rozdział w monografii naukowej / referat

37.

Enterprise Information Management in Cultural Heritage Domain / Cezary Mazurek (PCSS), Marcin Werla // W: Research and Practical Issues of Enterprise Information Systems: 12th IFIP WG 8.9 Working Conference, CONFENIS 2018, Held at the 24th IFIP World Computer Congress, WCC 2018, Poznan, Poland, September 18–19, 2018, Proceedings: Springer, Cham, 2018 - s. 3-14

Rozdział w monografii naukowej 5

38.

ETRA '18: Proceedings of the 2018 ACM Symposium on Eye Tracking Research & Applications / 2018

Monografia naukowa / materiały konferencyjne

39.

Graph algorithms for DNA sequencing - origins, current models and the future / Jacek Błażewicz (IChB), Marta Kasprzak (IChB), Wojciech Frohmberg, Paweł Wojciechowski (IChB), Aleksandra Świercz (IChB), Michał Kierzynka, Piotr Żurkowski // European Journal of Operational Research - 2018, 264, 3, s. 799-812

Artykuł naukowy 40

40.

QEva-CRISPR: A method for quantitative evaluation of CRISPR/Cas-mediated genome editing in target and off-target sites / Piotr Kozłowski (IChB), Wojciech Juzwa, Włodzimierz Krzyżosiak, Karol Czubak (IChB), Marta Olejniczak (IChB), Magdalena Dąbrowska // Nucleic Acids Research - 2018, 46, 17, s. e101

Artykuł naukowy 40

41.

Research and Practical Issues of Enterprise Information Systems: 12th IFIP WG 8.9 Working Conference, CONFENIS 2018, Held at the 24th IFIP World Computer Congress, WCC 2018, Poznan, Poland, September 18–19, 2018, Proceedings / Springer, Cham, 2018

Redakcja monografii naukowej

42.

RNApdbee 2.0: multifunctional tool for RNA structure annotation / Jacek Błażewicz (IChB), Michał Żurkowski, Maciej Antczak (IChB), Mariusz Popenda (IChB), Ryszard Adamiak (IChB), Marta Szachniuk (IChB), Tomasz Żok // Nucleic Acids Research - 2018, 46, s. W30-W35

Artykuł naukowy 40

43.

Scheduling aspects in keyword extraction problem / Jan Węglarz (PCSS), Michał Zimniewicz (PCSS), Krzysztof Kurowski (PCSS) // International Transactions in Operational Research - 2018, vol. 25, iss. 2, s. 507-522

Artykuł naukowy 20

44.

Software quality model for a research‐driven organization - An experience report / Jakub Chojnacki, Bartosz Walter, Marcin Wolski (PCSS), Szymon Kupiński (PCSS) // Journal of Software-Evolution and Process - 2018, 30, 5, s. e1911-1-e1911-14

Artykuł naukowy 20

45.

A Holistic Approach to Scientific Reasoning Based on Hybrid Knowledge Representations and Research Objects / Raul Palma (PCSS) // W: Proceedings of the Workshop on Machine Reading, co-located with The 9th International Conference on Knowledge Capture, 2017

Rozdział w monografii naukowej / referat

46.

A hydantoin isoform of cyclic N 6-threonylcarbamoyladenosine (ct6A) is present in tRNAs / Michał Matuszewski, Tsutomu Suzuki, Kenjyo Miyauchi, Elżbieta Sochacka, Zofia Gdaniec (IChB), Jakub Wojciechowski, Wojciech Wolf // Nucleic Acids Research - 2017, 45, 4, s. 2137-2149

Artykuł naukowy 40

47.

Bioinformatics Study of Structural Patterns in Plant MicroRNA Precursors / Katarzyna Tomczyk, Agnieszka Mickiewicz, Marta Szachniuk (IChB), Joanna Sarzyńska (IChB), Joanna Miśkiewicz // BioMed Research International - 2017, 2017, s. 6783010

Artykuł naukowy 25

48.

Crystal structures of nematode (parasitic T. spiralis and free living C. elegans), compared to mammalian, thymidylate synthases (TS). Molecular docking and molecular dynamics simulations in search for nematode-specific inhibitors of TS / Katarzyna Banaszak, Tomasz Frączyk, Agnieszka Bronowska, Adam Jarmuła, Magdalena Dąbrowska, Piotr Maj, Anna Dowierciał, Joanna Cieśla, Piotr Wilk, Wojciech Rypniewski (IChB), Jan Ludwiczak, Wojciech Rode, Sławomir Filipek, Jakub Jakowiecki // Journal of Molecular Graphics and Modelling - 2017, 77, s. 33-50

Artykuł naukowy 25

49.

Discriminating RNA variants with single-molecule allele-specific FISH / Martyna Urbanek-Trzeciak (IChB), Włodzimierz Krzyżosiak // MUTATION RESEARCH-REVIEWS IN MUTATION RESEARCH - 2017, 773, s. 230-241

Artykuł naukowy 45

50.

Efficient Synthesis of Long-Chain N’-hydroxy-N-alkyl- and -N,N-dialkylpyridinecarboximidamides / Irmina Wojciechowska, Grzegorz Framski (IChB), Aleksandra Wojciechowska, Przemysław Aksamitowski, Karolina Wieszczycka // Modern Organic Chemistry Research (MOCR) - 2017, 2, 1, s. 17-24

Artykuł naukowy 1

51.

Ensuring the Quality of Research Objects in the Earth Science Domain / Raul Palma (PCSS) // W: Proceedings of 13th IEEE International Conference on eScience, eScience 2017, 2017 - s. 442-443

Rozdział w monografii naukowej / referat

52.

L1Base 2: more retrotransposition-active LINE-1s, more mammalian genomes / Tobias Penzkofer, Tomasz Żemojtel, Peter N. Robinson, Marten Jaeger, Marek Figlerowicz (IChB), Richard Badge, Stefan Mundlos // Nucleic Acids Research - 2017, 45, D1, s. D68-D73

Artykuł naukowy 40

53.

Meeting report: Third Summer School on Innovative Approaches for Identification of Antiviral Agents (IAAASS) / Joanna Sztuba-Solinska, Elias Maccioni, Cristina Parolin, Enzo Tramontano, Stuart F. J. Le Grice, Katarzyna Purzycka (IChB) // Antiviral Research - 2017, 139, s. 13-17

Artykuł naukowy 35

54.

Research Object jako mechanizm zapewnienia powtarzalności eksperymentu naukowego w ramach Wirtualnych Środowisk Badawczych / Raul Palma (PCSS), Marcin Krystek (PCSS), Cezary Mazurek (PCSS) // W: VIII Krajowa Konferencja Naukowa INFOBAZY 2017 dane - wiedza - e-usługi, 2017 - s. 13-15

Rozdział w monografii naukowej / referat

55.

Stabilization of RNA hairpins using non-nucleotide linkers and circularization / Wojciech Rypniewski (IChB), Agnieszka Kiliszek (IChB), Leszek Błaszczyk (IChB), Ryszard Kierzek (IChB) // Nucleic Acids Research - 2017, 45, 10, s. e92

Artykuł naukowy 40

56.

Supporting research and operational Earth Science portals through ROHub / Raul Palma (PCSS), Marcin Krystek (PCSS) // W: Proceedings of 13th IEEE International Conference on eScience, eScience 2017, 2017 - s. 460-461

Rozdział w monografii naukowej / referat

57.

Synthesis and spectral analysis of pyridine derivates / Aleksandra Wojciechowska, Grzegorz Framski (IChB), Karolina Wieszczycka // Modern Organic Chemistry Research (MOCR) - 2017, 2, nr 2, s. 41-47

Artykuł naukowy 1

58.

Synthesis of pyridyl-β-ketophosphonates / Grzegorz Framski (IChB), Krzysztof Bukowski, Karolina Wieszczycka // Modern Organic Chemistry Research (MOCR) - 2017, 2, nr 2, s. 67-73

Artykuł naukowy 1

59.

Towards a Human-Machine Scientific Partnership Based on Sematically Rich Research Objects / Raul Palma (PCSS) // W: Proceedings of 13th IEEE International Conference on eScience, eScience 2017, 2017 - s. 266-275

Rozdział w monografii naukowej / referat